傳統(tǒng)的蛋白測序技術(shù)高度依賴于已有的蛋白數(shù)據(jù)庫資源。目前大多數(shù)測序需要將測得的多肽序列在蛋白或基因組數(shù)據(jù)庫中進行搜索, 再與同源序列進行比對和匹配,然而,由于一些蛋白序列尚未被測序或納入數(shù)據(jù)庫中,這就往往導(dǎo)致對某些蛋白的無法比對或錯誤識別。
快序生物開發(fā)的從頭測序技術(shù)(de novo sequencing),完全不依賴于任何已知的DNA或者蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫信息,直接對蛋白質(zhì)氨基酸 序列進行測定。蛋白從頭測序的原理是基于蛋白酶切后的肽段分子在質(zhì)譜儀中有規(guī)律的斷裂,找到特定斷裂模式,再根據(jù)質(zhì)譜峰之間 質(zhì)量差即可算出對應(yīng)的氨基酸信息,以及氨基酸上的翻譯后修飾。使用這項技術(shù)不僅能揭示全新的未知蛋白序列,還能捕捉到突變位 點信息,從而打破了對傳統(tǒng)數(shù)據(jù)庫的依賴,真正踏入了蛋白測序的新紀元。