蛋白質(zhì)從頭測序（de novo protein sequencing）

蛋白質(zhì)測序是利用質(zhì)譜 (MS)等方法來確定蛋白質(zhì)氨基酸序列的技術(shù)。在質(zhì)譜技術(shù)發(fā)展之前，蛋白質(zhì)的測序主要通過埃德曼降解法（Edman degradation），埃德曼降解法是一種通過逐步從N端降解多肽來獲得氨基酸順序的方法，如今，埃德曼降解法因其技術(shù)局限已廣泛被質(zhì)譜法所取代。

蛋白質(zhì)從頭測序（de novo protein sequencing）是一種不依賴于任何已知的序列或者蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫信息，直接對蛋白質(zhì)氨基酸序列進(jìn)行測定的全新測序技術(shù)，此技術(shù)對于鑒定全新蛋白的作用尤為突出?？贵w作為我們免疫系統(tǒng)中必不可少的分子，是醫(yī)療診斷和治療領(lǐng)域的寶貴工具，因此蛋白質(zhì)從頭測序在抗體領(lǐng)域中有著重要應(yīng)用。

目前標(biāo)準(zhǔn)的抗體生產(chǎn)流程是首先用抗原對動物進(jìn)行免疫，刺激天然免疫反應(yīng)，產(chǎn)生多克隆抗體，其次使用雜交瘤或單細(xì)胞測序等分子技術(shù)，多抗混合物中分離單個克隆體，也就是單克隆抗體。然而，即使使用相同的抗原對動物進(jìn)行免疫，不同批次間產(chǎn)生的抗體都有可能存在差異，用DNA 測序的方法進(jìn)行鑒定十分困難。

基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)從頭測序技術(shù)為以上難題提供了直接有效的解決方法，蛋白質(zhì)從頭測序可以直接確定單克隆抗體的氨基酸序列，所獲得的序列信息可用于抗體的體外重組表達(dá)，保證了可重復(fù)性。蛋白質(zhì)從頭測序還可與生物物理和生化方法技術(shù)結(jié)合，用于研究分析抗體的結(jié)構(gòu)、親和力以及翻譯后修飾（PTM）。同時，蛋白質(zhì)從頭測序避免了基于同源性數(shù)據(jù)庫搜索中所產(chǎn)生的錯誤配對問題，是抗體驗證過程的重要工具。此外，蛋白質(zhì)從頭測序可大大減少實驗動物的使用，節(jié)約研究成本。

作為抗體蛋白測序領(lǐng)域的全球領(lǐng)跑者，快序生物擁有先進(jìn)的從頭蛋白測序軟件和質(zhì)譜技術(shù)，提供抗體測序服務(wù)，以及抗體表達(dá)服務(wù)，只需 0.1 mg 的抗體蛋白樣品，即可保證從 N 端到 C 端，重鏈輕鏈準(zhǔn)確配對的100%序列覆蓋，以便您對您的抗體蛋白質(zhì)序列充滿信心，確保重組抗體表達(dá)的成功。

參考文獻(xiàn)

1. Ma, B., and Johnson, R. De novo sequencing and homology searching. Mol. Cell. Proteomics. 11(2):O111.014902 (2012).

2. Ma, B. Novor: Real-Time Peptide de Novo Sequencing Software. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 26, 1885–1894 (2015).