技術(shù)流程
1. 提取與MHC I結(jié)合的肽段:
1)弱酸洗脫(mild acid elution, MAE): 實(shí)驗(yàn)步驟少,樣品損失少,無需破碎細(xì)胞;
2)免疫沉淀(immunoprecipitation, IP): 所得肽段的特異性更強(qiáng),肽段數(shù)目也更多,但實(shí)驗(yàn)步驟多,樣品損失較大,所以需要的細(xì)胞數(shù)目也較多。
2. 質(zhì)譜鑒定:所有肽段經(jīng)過高分辨率的質(zhì)譜儀分析,得到大量高精度,高可信度的數(shù)據(jù)。
3. 數(shù)據(jù)分析:質(zhì)譜數(shù)據(jù)經(jīng)由我們公司獨(dú)立研發(fā)的De novo測(cè)序平臺(tái)分析,可以獲得大量潛在的新抗原序列。